MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Clostridium tetani 12124569

Total Repeats: 489

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_022778	TAA	2	6	13	18	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
2	NC_022778	AAT	2	6	59	64	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3	NC_022778	AT	3	6	79	84	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
4	NC_022778	ATT	2	6	127	132	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5	NC_022778	ATGA	2	8	146	153	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
6	NC_022778	TTA	2	6	158	163	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
7	NC_022778	TAAA	2	8	725	732	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
8	NC_022778	A	6	6	1391	1396	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
9	NC_022778	TTA	2	6	1400	1405	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
10	NC_022778	ATG	2	6	1415	1420	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
11	NC_022778	ATA	2	6	1432	1437	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
12	NC_022778	TTA	2	6	1463	1468	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
13	NC_022778	GGA	2	6	1860	1865	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
14	NC_022778	TCC	2	6	2322	2327	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
15	NC_022778	AT	4	8	2342	2349	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
16	NC_022778	GGT	2	6	2402	2407	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
17	NC_022778	TACT	2	8	2620	2627	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
18	NC_022778	TTTA	2	8	2628	2635	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
19	NC_022778	AGTA	2	8	2647	2654	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
20	NC_022778	T	7	7	2681	2687	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
21	NC_022778	ATT	2	6	2690	2695	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
22	NC_022778	TA	3	6	2711	2716	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
23	NC_022778	TATAA	2	10	2751	2760	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
24	NC_022778	ATA	2	6	2774	2779	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
25	NC_022778	TAA	2	6	3284	3289	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
26	NC_022778	CTA	2	6	3297	3302	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
27	NC_022778	A	7	7	3310	3316	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
28	NC_022778	ATTA	2	8	3365	3372	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
29	NC_022778	TTA	2	6	3386	3391	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
30	NC_022778	GTT	2	6	3432	3437	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
31	NC_022778	ATT	2	6	3439	3444	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
32	NC_022778	ATT	2	6	4554	4559	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
33	NC_022778	CCT	2	6	4561	4566	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
34	NC_022778	ACTT	2	8	4573	4580	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
35	NC_022778	AAT	2	6	4583	4588	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
36	NC_022778	TAT	2	6	4637	4642	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
37	NC_022778	ATA	2	6	4686	4691	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
38	NC_022778	T	7	7	4695	4701	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
39	NC_022778	TA	3	6	4751	4756	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
40	NC_022778	AT	3	6	4810	4815	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
41	NC_022778	TAT	2	6	5275	5280	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
42	NC_022778	TTA	2	6	5313	5318	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
43	NC_022778	TTA	2	6	5331	5336	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
44	NC_022778	ATTA	2	8	5573	5580	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
45	NC_022778	TTA	2	6	5596	5601	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
46	NC_022778	AT	3	6	5620	5625	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
47	NC_022778	AATT	2	8	5637	5644	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
48	NC_022778	TAAA	2	8	5720	5727	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
49	NC_022778	ATT	2	6	5739	5744	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
50	NC_022778	TAA	2	6	5786	5791	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
51	NC_022778	AT	3	6	5798	5803	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
52	NC_022778	ATA	2	6	7170	7175	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
53	NC_022778	A	6	6	7188	7193	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
54	NC_022778	TAA	2	6	7204	7209	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
55	NC_022778	T	6	6	7219	7224	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
56	NC_022778	TGA	2	6	7233	7238	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
57	NC_022778	AT	3	6	7245	7250	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
58	NC_022778	ATATT	2	10	7256	7265	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
59	NC_022778	CTT	2	6	8113	8118	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
60	NC_022778	TAG	2	6	8142	8147	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
61	NC_022778	CAA	2	6	8182	8187	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
62	NC_022778	ATATA	2	10	8214	8223	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
63	NC_022778	A	6	6	8239	8244	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
64	NC_022778	AAAT	2	8	8914	8921	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
65	NC_022778	AAG	2	6	9475	9480	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
66	NC_022778	A	6	6	12679	12684	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
67	NC_022778	AAT	2	6	12716	12721	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
68	NC_022778	AT	3	6	12732	12737	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
69	NC_022778	ATA	2	6	12968	12973	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
70	NC_022778	ACCTT	2	10	12995	13004	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
71	NC_022778	GTAT	2	8	13067	13074	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
72	NC_022778	T	7	7	13085	13091	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
73	NC_022778	TCTA	2	8	13169	13176	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
74	NC_022778	TA	4	8	13511	13518	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
75	NC_022778	TAA	2	6	13533	13538	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
76	NC_022778	AT	3	6	13541	13546	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
77	NC_022778	TGT	3	9	13556	13564	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
78	NC_022778	CTT	2	6	13656	13661	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
79	NC_022778	CTTT	2	8	13720	13727	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
80	NC_022778	ATA	2	6	13765	13770	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
81	NC_022778	TGT	2	6	16543	16548	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
82	NC_022778	CCT	2	6	16583	16588	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
83	NC_022778	AATT	2	8	16605	16612	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
84	NC_022778	TAT	2	6	16624	16629	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
85	NC_022778	TA	3	6	16651	16656	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
86	NC_022778	ATA	2	6	16666	16671	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
87	NC_022778	AAAT	2	8	16685	16692	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
88	NC_022778	AT	3	6	16691	16696	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
89	NC_022778	TAT	2	6	16710	16715	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
90	NC_022778	ATTT	2	8	16720	16727	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
91	NC_022778	TA	3	6	16728	16733	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
92	NC_022778	TTA	2	6	17283	17288	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
93	NC_022778	AAAT	2	8	17536	17543	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
94	NC_022778	ATA	2	6	17560	17565	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
95	NC_022778	AT	3	6	17590	17595	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
96	NC_022778	T	6	6	17614	17619	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
97	NC_022778	GAT	2	6	17626	17631	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
98	NC_022778	ATT	2	6	17632	17637	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
99	NC_022778	ATA	2	6	17638	17643	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
100	NC_022778	T	7	7	17745	17751	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
101	NC_022778	T	6	6	17778	17783	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
102	NC_022778	T	6	6	17798	17803	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
103	NC_022778	A	6	6	17820	17825	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
104	NC_022778	TA	3	6	17861	17866	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
105	NC_022778	TAA	2	6	17870	17875	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
106	NC_022778	AT	3	6	17877	17882	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
107	NC_022778	AAAT	2	8	17884	17891	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
108	NC_022778	A	6	6	17898	17903	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
109	NC_022778	ACA	2	6	17923	17928	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
110	NC_022778	ATT	2	6	17939	17944	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
111	NC_022778	T	7	7	17954	17960	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
112	NC_022778	TTTA	2	8	17990	17997	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
113	NC_022778	TGA	2	6	18038	18043	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
114	NC_022778	CAT	2	6	18067	18072	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
115	NC_022778	TAA	2	6	18142	18147	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
116	NC_022778	ATT	3	9	18665	18673	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
117	NC_022778	GTTT	2	8	18706	18713	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
118	NC_022778	TA	3	6	18715	18720	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
119	NC_022778	ATT	2	6	18732	18737	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
120	NC_022778	TAT	2	6	18783	18788	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
121	NC_022778	AT	3	6	18794	18799	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
122	NC_022778	ATT	2	6	18835	18840	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
123	NC_022778	TTTTA	2	10	18846	18855	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
124	NC_022778	TTA	2	6	18859	18864	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
125	NC_022778	ATA	2	6	18872	18877	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
126	NC_022778	AACT	2	8	18888	18895	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
127	NC_022778	GGA	2	6	18925	18930	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
128	NC_022778	T	6	6	18934	18939	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
129	NC_022778	ATAA	2	8	18940	18947	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
130	NC_022778	ATT	2	6	18949	18954	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
131	NC_022778	GAA	2	6	18963	18968	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
132	NC_022778	A	6	6	18976	18981	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
133	NC_022778	GATT	2	8	19032	19039	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
134	NC_022778	TAAT	2	8	19308	19315	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
135	NC_022778	CTA	2	6	19316	19321	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
136	NC_022778	AAT	2	6	19343	19348	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
137	NC_022778	AT	4	8	19347	19354	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
138	NC_022778	TAC	2	6	19355	19360	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
139	NC_022778	AAT	2	6	19394	19399	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
140	NC_022778	TGT	2	6	19411	19416	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
141	NC_022778	TAA	2	6	19835	19840	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
142	NC_022778	TA	3	6	19848	19853	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
143	NC_022778	T	6	6	19862	19867	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
144	NC_022778	AAT	2	6	19891	19896	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
145	NC_022778	ATA	2	6	19915	19920	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
146	NC_022778	TAA	2	6	19943	19948	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
147	NC_022778	CATAA	2	10	19951	19960	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
148	NC_022778	TA	4	8	19972	19979	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
149	NC_022778	TA	3	6	20019	20024	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
150	NC_022778	ATTTT	2	10	20079	20088	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
151	NC_022778	TA	3	6	20093	20098	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
152	NC_022778	AT	3	6	20136	20141	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
153	NC_022778	TAT	2	6	20173	20178	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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448	NC_022778	A	6	6	55393	55398	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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453	NC_022778	AAG	2	6	55542	55547	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.